ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ОБ ЭВОЛЮЦИИ ТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ
https://doi.org/10.21292/2075-1230-2018-96-8-59-65
Аннотация
Представлены данные литературы по изучению эволюции возбудителя туберкулеза и сущности процессов, приведших к современному разнообразию микобактерий туберкулеза. Использование молекулярных методов с другими вспомогательными средствами позволило изменить взгляды на историю микобактерий туберкулезного комплекса, приведя к созданию нового эволюционного сценария.
Об авторе
В. Л. Добин
ФГБОУ ВО «Рязанский государственный медицинский университет им. акад. И. П. Павлова» МЗ РФ.
Россия
Россия
Добин Виталий Лазаревич доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой фтизиатрии с курсом лучевой диагностики.
390026, г. Рязань, ул. Высоковольтная, д. 9.
Список литературы
1. Мокроусов И. В. Генетическое разнообразие и эволюция Mуcobacterium tuberculosis: Автореф. дис. … д-ра мед. наук. ‒ СПб., 2009. – 40 с.
2. Прозоров А. А., Даниленко В. Н. Микобактерии туберкулезного комлекса: геномика, молекулярная эпидемиология, пути эволюции // Усп. совр. биологии. ‒ 2011. ‒ № 3. ‒ С. 227-243.
3. Baker L., Brown N., Maiden M. et al. Silent nucleotide polymorphisms and a phylogeny for Mycobacterium tuberculosis // Emer. Inf. Dis. ‒ 2004. ‒ Vol. 10, № 9. ‒ 1568-1574.
4. Bentley S. D., Comas I., Bryant J. M., Walker D., Smith N. H. et al. The genome of Mycobacterium africanum West African 2 reveals a lineage-specific locus and genome erosion common to the M. tuberculosis complex // PLoS Negl. Trop. Dis. ‒ 2012. ‒ Vol. 6, № 2. ‒ P. e1552.
5. Bos К. et al. Pre-Columbian mycobacterial genomes reveal seals as a source of New World human tuberculosis // Nature. ‒ 2014. ‒ Vol. 514. ‒ Р. 494-497.
6. Brosch R. et al. A new evolutionary scenario for the Mycobacterium tuberculosis complex // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. ‒ 2002. ‒ Vol. 99. ‒ Р. 3684-3689.
7. Comas I. et al. Out-ol-Alrica migration and Neolithic coexpansion of Mycobacterium tuberculosis with modern humans // Nature Genet. ‒ 2013. ‒ Vol. 45. ‒ Р. ‒ 1176-1182.
8. Comas I., Chakravartti J., Small P. M., Galagan J., Niemann S. et al. Human T cell epitopes of Mycobacterium tuberculosis are evolutionarily hyperconserved // Nat. Genet. ‒ 2010. ‒ Vol. 42, № 6. ‒ P. 498-503.
9. Djelouadji Z., Raoult D., Drancourt M. Palaeogenomics of Mycobacterium tuberculosis: epidemic bursts with a degrading genome // Lancet Infect. Dis. ‒ 2011. ‒ Vol. 11. ‒ Р. 641-650.
10. Dos Vultos T., Mestre O., Golec M. et al. Evolution and diversity of clonal bacteria: The Paradigm of Mycobacterium tuberculosis // Plos ONE. ‒ 2008. ‒ Vol. 3, № 2. ‒ Р. 1538-1551.
11. Ernst J., Trevejo-Nunez G. Genomics and the evolution, pathogenesis, and diagnosis of tuberculosis // Clin. Invest. ‒ 2007. ‒ Vol. 117, № 7. ‒ 1738-1745.
12. Fabre М., Koeck J., Le Fleche P., Simon F., Herve V. et al. High genetic diversity revealed by variable-number tandem repeat genotyping and analysis of hsp65 gene polymorphism in a large collection of “Mycobacterium canetti” strains indicates that the M. tuberculosis complex is a recently emerged clone of “M. canetti” // J. Clin. Microbiol. ‒ 2004. ‒ Vol. 42. ‒ 3248-3255.
13. Fleisclnmmn R., Alland D., Eisen J., Carpenter L., White O., et al. Whole-genome comparison of Mycobacterium tuberculosis clinical and laboratory strains // J. Bacteriol. ‒ 2002. ‒ Vol. 184. ‒ Р. 5479-5490.
14. Fletcher H., Donoghue H., Holton I., Pap I., Spigelman M. Widespread occurrence of Mycobacterium tuberculosis DNA from 18th-19th century Hungarians // Am. J. Phys. Anthropol. ‒ 2003. ‒ Vol. 120. ‒ Р. 144-152.
15. Fletcher H., Donoghue H., Taylor G., van der Zanden A. Molecular analysis of Mycobacterium tuberculosis DNA from a family of 18th century Hungarians // Microbiology. ‒ 2003. ‒ Vol. 149. ‒ Р. 143-151.
16. Garnier T., Eiglmeier K., Camus J. C., Medina N., Mansoor H. et al. The complete genome sequence of Mycobacterium bovis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. ‒ 2003. ‒ Vol. 100, № 13. ‒ P. 7877-7882.
17. Glynn J., Whiteley J., Bifani P., Kremer K., van Soolingen D. Worldwide occurrence of Beijing W strains of Mycobacterium tuberculosis a systematic review // Emer. Inf. Dis. ‒ 2002. ‒ Vol. 8. ‒ Р. 843-849.
18. Gutacker M., Smoot J., Migliaccio G., Ricklefs S., Hua S. et al. Genome-wide analysis of synonymous single nucleotide polymorphisms in Mycobacierium tuberculosis complex organisms: Resolution of genetic relationships among closely related microbial strains // Genetics. ‒ 2002. ‒ Vol. 162. ‒ Р. 1533-1543.
19. Gutierrez M. et al. Ancient origin and gene mosaicism of the progenitor of Mycobacterium tuberculosis // PLoS Pathogens. ‒ 2005. ‒ Vol. 1. ‒ Р. e5.
20. Hershkovitz l. el al. Detection and molecular characterization of 9,000-year-old Mycobacterium tuberculosis from a Neolithic settlement in the Eastern Mediterranean // PLoS ONE. ‒ 2008. ‒ Vol. 3. ‒ Р. 3426.
21. Hughes A., Friedman R., Murray M. Genomewide pattern of synonymous nucleotide substitution in two complete genomes of Mycobacterium tuberculosis // Emer. Inf. Dis. ‒ 2002. ‒ Vol. 8. ‒ Р. 1342-1346.
22. Jonsson H., Ginolhac A., Schubert M., Johnson P. mapDamage.2.0: fast approximate Bayesian estimates of ancient DNA damage parameters // Bioinformatics. ‒ 2013. ‒ Vol. 29. ‒ Р. 1682-1684.
23. Kamerbeek J., Schools L., Kolk A., van Agterveld M., van Soolingen D. et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology // J. Clin. Microbiol. ‒ 1997. ‒ Vol. 35. ‒ Р. 907-914.
24. Karbou R. A., van Pittiust N., Namouchi A. Insights into the evolutionary history of tubercle bacilli as disclosed by genetic rearrangements within a PE PGRS duplicated gene pair // BMC Evoluctionary Biology. ‒ 2006. ‒ doi 10 1:86/1471-2148 6 107
25. Mostowy S., Cousins D., Brinkman J., Aranaz A., Behr M. Genomic deletions suggest a phylogeny for the Mycobacterium tuberculosis complex // J. Infect. Dis. 2002. ‒ Vol. 186. ‒ Р. 74-80.
26. Muller R., Roberts C., Brown T. Genotyping of ancient Mycobacterium tuberculosis strains reveals historic genetic diversity // Proc. Biol. Sci. ‒ 2014. ‒ Vol. 281. ‒ Р. 2013-3236.
27. Nicklisсh N. et al. Rib lesions in skeletons from early neolithic sites in Central Germany: on the trail of tuberculosis at the onset of agriculture // Am. J. Phys. Anthropol. ‒ 2012. ‒ Vol. 149. ‒ Р. 391-404.
28. Parwati I., van Crevel R., van Soolingen D. Possible underlying mechanisms for successful emergence of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype strains // Lancet Infect. Dis. ‒ 2010. ‒ Vol. 10, № 2. ‒ P. 103-111.
29. Rothschild В. et al. Mycobacterium tuberculosis complex DNA from an extinct bison dated 17,000 years before the present // Clin. Infect. Dis. ‒ 2001. ‒ Vol. 33. ‒ Р. 305-311.
30. Semaw S., Simpson S., Quade J., Reime P., Butler R. et al. Early Pliocene gominids from Gona, Ethiopia // Nature. ‒ 2005. ‒ Vol. 433. ‒ Р. 301-305.
31. Sreevatsan S., Pan X., Stockbauer K., Connell N., Kreiswirth B. et al. Restricted structural gene polymorphism in the Mycobacterium tuberculosis complex indicates evolutionarily recent global dissemination // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. ‒ 1997. ‒ Vol. 94. ‒ Р. 9869-9874.
32. Supply P., Marceau1 M., Mangenot S. et al. Genome analysis of smooth tubercle bacilli provides insights into ancestry and pathoadaptation of the etiologic agent of tuberculosis // Nat. Genet. ‒ 2013. ‒ Vol. 15, № 2. ‒ Р. 172-179.
33. Taylor G., Murphy E., Hopkins., Rutland P., Chisiov Y. First report of Mycobacterium bovis DNA in human remains from the Iron Age // Microbiology. ‒ 2007. ‒ Vol. 153. ‒ Р. 1243-1249.
34. Tsolaki G., Hirsh E., De Riemer K. et al. Functional and evolutionary genomics of Mycobacterium tuberculosis: Insights from genomic deletions in 100 strains // PNAS. ‒ 2004 ‒ Vol. 101, № 14. ‒ Р. 4865-4870.
Рецензия
Для цитирования:
Добин В.Л. ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ОБ ЭВОЛЮЦИИ ТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ. Туберкулез и болезни легких. 2018;96(8):59-65. https://doi.org/10.21292/2075-1230-2018-96-8-59-65
For citation:
Dobin V.L. UNDERSTANDING OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS EVOLUTION. Tuberculosis and Lung Diseases. 2018;96(8):59-65. (In Russ.) https://doi.org/10.21292/2075-1230-2018-96-8-59-65
Просмотров:
1354
Послать статью по эл. почте 